bullx™, le nouveau supercalculateur de Bull à l’Université de Cologne
TEMPS FORT
Le système que livrera Bull au Centre de Calcul Régional basé à l’Université de Cologne offre une puissance équivalente à celle de 5000 PC. Les principaux domaines d’applications : la chimie, la physique et les biosciences. Sa puissance de calcul rendra possible de nombreuses simulations nouvelles et permettra d’affiner les simulations existantes.
bullx, nouvelle génération de serveurs Bull dédiée à l’Extreme Computing et annoncée en juin 2009, fournira une puissance de calcul de 100 Tflop/s. Pour la première phase du projet, le supercalculateur bullx comprend 215 nœuds de calcul, équipés chacun de deux processeurs Intel® Xeon® 5500 quadri-cœurs « Nehalem EP », reliés par un réseau ultramoderne InfiniBand QDR (Quadruple Data Rate) pour garantir des échanges de données extrêmement rapides. Cela permet le traitement des applications massivement parallèles (applications à mémoire distribuée, applications à mémoire partagée), mais aussi des calculs en série, qui sont très importants pour les études de paramètres. La mise en exploitation du supercalculateur est prévue dès le début 2010.
Durant l’été 2010, Bull installera au Centre de Calcul Régional de Cologne 602 nœuds de calcul supplémentaires, équipés chacun de deux processeurs Intel Westmere (six cœurs de calcul), alors disponibles. Pour les applications à mémoire partagée très gourmandes en mémoire, quatre grands serveurs Bull de 128 cœurs chacun seront également ajoutés, dont un serveur avec un téraoctet de mémoire vive et trois serveurs avec 512 giga-octets de mémoire vive.
« A terme, le système offrira un total de 26 téraoctets de mémoire vive et 500 téraoctets de stockage sur disque pour les énormes volumes de données accumulés, accessibles au travers d’une liaison InfiniBand avec une bande passante totale de 10 giga-octets/sec » a déclaré Michael Gerhards, Directeur Général de Bull Allemagne. « Le système de fichiers parallèle mis en œuvre est Lustre et le système d’exploitation du supercalculateur est Red Hat Enterprise Linux. Une partie des nœuds de calcul supportera également Microsoft Windows HPC Server. Et le système de gestion des travaux et de pilotage inclut entre autres myJAM, un logiciel développé par l’Université de Düsseldorf en partenariat avec Bull, et destiné spécifiquement aux environnements de clusters hétérogènes. »
L’apport du supercalculateur bullx sera très important pour les travaux de recherche des nombreux scientifiques qui ont déjà gagné en efficacité avec l’aide du CCG (Centre de Génomique de Cologne) dirigé par le Professeur Peter Nürnberg. Depuis sa création en 2005, le CCG soutient de nombreux projets de recherche relatifs à la compréhension des modifications génétiques liées aux maladies complexes telles que l’épilepsie et le cancer. Pour préparer et analyser les immenses volumes de données correspondants, et réaliser des simulations à grande échelle, plus de puissance de calcul était indispensable. D’autres scientifiques étudieront grâce au nouveau supercalculateur les propriétés de matériaux ‘high-tech’ tels que les supports de stockage magnétiques ultra-denses, de nouveaux types de catalyseurs très efficaces et des composants nano-technologiques. Des météorologues, des astrophysiciens et des économistes tireront également partie des performances du nouveau système pour la réalisation de leurs simulations.
L’Université de Cologne, avec ses 42 000 étudiants, compte parmi les établissements de recherche les plus renommés d’Allemagne. Dans le domaine des calculateurs haute performance en particulier, l’Université a une tradition de recherche qui remonte à plus de cinquante ans. Le Professeur Ulrich Lang, Directeur du RRZK et titulaire d’une Chaire d’informatique, étudie avec son équipe de nombreux domaines scientifiques innovants, tels que les grilles informatiques (grid computing), la parallélisation d’algorithmes, la visualisation scientifique, la visualisation parallèle, l’interaction homme-machine ou le travail coopératif assisté par ordinateur. Depuis 2004, un système de projection stéréo permet de visualiser les résultats de simulations issues de diverses disciplines.
